Star Trek the Next Generation

El juego comienza con la USS Enterprise (NCC-1701-D) en órbita alrededor de una gigante roja en las cercanías de la Franja Neutral (la estrella afecta adversamente los sensores Romulanos, haciendo que la Enterprise sea indetectable). Están vigilando la frontera en respuesta al aumento de actividad Romulana; los Romulanos perdieron contacto recientemente con una nave que patrullaba la Franja Neutral. La Flota Estelar aceptó ayudar en cualquier investigación como símbolo de buena voluntad. Los Romulanos rechazan la ayuda y prefieren manejarlo por su cuenta, lo que naturalmente lleva a la Flota a aumentar las patrullas en la frontera. Inmediatamente al comenzar el juego, la Enterprise recibe una señal de socorro, transmitida en todas las frecuencias. Fue enviada por la Dra. T'Laris, una geóloga Vulcana que trabaja en un planeta del sistema Codis Mu (Codis Mu VI), y en el mensaje señala que su sitio de excavación fue atacado recientemente por Romulanos, y que los atacantes aún están presentes. La Enterprise responde a su llamada y se dirige hacia su sitio de excavación. A medida que avanza el juego, el jugador descubre más sobre la misión de la nave Romulana desaparecida y sobre el IFD. La Enterprise también entra en contacto con una raza alienígena conocida como los Chodak, criaturas hostiles similares a moluscos que constantemente acosan a la Enterprise mientras atraviesa el espacio conocido recopilando pistas sobre el IFD. También se mencionan una raza ahora extinta llamada los Senatorious, que fueron los últimos en poseer el IFD; la razón de su resurgimiento es porque los Senatorious entendieron que habían estado usando el IFD para su propio beneficio a costa de todas las demás razas, y decidieron enviarlo diez mil años en el futuro, con la esperanza de que las civilizaciones entonces existentes pudieran aprovecharlo en beneficio mutuo de todas las razas. Hay otra raza, los eunacos delgados, que solo se encuentran una vez y, tras que la Enterprise repare su nave, le cuentan a Jean-Luc Picard sobre los Ensayos del IFD y la intención de los Eunacos de participar. Sin embargo, con su nave dañada y el resto de su raza viviendo en el Cuadrante Gamma, confían en la Federación la recuperación del IFD y su uso juicioso.