Pokemon Puzzle Collection

El jugador puede elegir entre una selección de diferentes tipos de puzzles. Inicialmente, las opciones disponibles son Shadow Puzzle, Motion Puzzle y Rescue Mission, pero después de completar 30 puzzles, se desbloquea una cuarta variedad, Power On. Hay 20 puzzles para cada tipo, divididos en cinco niveles, con cuatro puzzles por nivel. Cuanto mayor sea el nivel del puzzle, mayor será su dificultad. Una vez resuelto un puzzle, el Pokémon involucrado en él se añade al Pokédex del juego, el Minidex.