Spongebob Squarepants Movin' with Friends

El juego comienza con SpongeBob y sus amigos escapando de Atlantis. Mientras tanto, Plankton causa estragos en Atlantis con un tanque que "prestó" hasta que se encuentra con el grupo. SpongeBob y Patrick empiezan a recordar cómo llegaron a este lío. Comienzan a tener un momento de recuerdo que empieza con ellos haciendo burbujas hasta que quedan atrapados en una gran burbuja que los lleva a una cueva. El dúo avanza por la cueva, evitando piratas fantasma mientras buscan escaleras para adentrarse más en las cavernas, donde encuentran la mitad perdida del Amuleto Atlanteano (Patrick piensa que está relacionado con los antepasados de SpongeBob por la palabra "antis" en él). Lo llevan al Museo de Bikini Bottom para ver qué es, tomando fotos de las exhibiciones y enfrentándose a turistas y guardias que bloquean el camino. Squidward se sorprende al ver que encontraron la otra mitad del amuleto. Sandy y Mr. Krabs acompañan mientras caminan por el museo. Squidward une las dos mitades y se revela el camino a Atlantis: es un autobús volador. El autobús funciona con canciones, y el grupo empieza a cantar para llegar a Atlantis. El autobús se estrellan en el camino debido a un error de Patrick, obligando a la banda a conducir el autobús por Atlantis para encontrar las piezas del autobús y las herramientas necesarias para arreglarlo. Después de reparar el autobús y llegar a Atlantis, el grupo es recibido por el Lord Royal Highness (o LRH). LRH realiza un recorrido por el palacio Atlanteano, en el que deben evitar trampas colocadas en Atlantis por alguna razón. Mr. Krabs empieza a recoger algunos tesoros para llevarse, con la ayuda de Sandy y su pistola de atrapar burbujas. Squidward posa para los artistas en el estudio de arte. Sin que ellos lo sepan, Plankton se escondió en el compartimiento del autobús de Atlantis en el camino hasta aquí. Planea usar las armas de Atlantis, las más avanzadas de todos los tiempos, para destruir a SpongeBob y sus amigos, y tomar el control del mundo. Después de salir del autobús, se escabulle por Atlantis y llega a la sala de armas. Mientras toma fotos de las atracciones (y también enfrentándose a turistas y guardias atlantes que bloquean el camino), Patrick accidentalmente destruye la burbuja más antigua viviente y le dice la verdad a LRH, quien les muestra la burbuja real. Squidward les recuerda que la burbuja que Patrick destruyó era un elemento de utilería para los turistas. Patrick la explota nuevamente y en serio, enfureciendo a LRH. El grupo corre para escapar, en la que deben esquivar las fuerzas atlantes mientras buscan clips para desbloquear puertas. Más tarde, Sandy Usa a Squidward como arma para derrotar a los soldados. Plankton causa estragos en la ciudad con su tanque igual que al principio y enfrenta al grupo, terminando el flashback. Él dispara su arma, pero se sorprende al ver que dispara helado. LRH captura a Plankton, creyendo que es un punto parlante, y lo exhibe como reemplazo de la burbuja destruida y como sustituto del tesoro nacional de Atlantis. Luego ordena a uno de sus soldados deshacerse del amuleto para que los problemáticos no puedan volver. El soldado atraviesa Atlantis hasta el contenedor de basura y arroja allí el amuleto. El grupo regresa a casa en Bikini Bottom a bordo del autobús.