Shinobi

El juego cuenta con ocho niveles, cada uno dividido en dos secciones, y con jefes a lo largo del camino. El esquema de control permite dash, ataque, saltar y lanzar shurikens. También se cuenta con una función de fijación de objetivos. Cabe destacar que el juego también tiene algunas funciones ocultas, como mantener pulsado el botón de ataque durante la fijación para realizar un ataque cargado, saltar doble y lanzar shuriken para hacer una ráfaga de shuriken, y una patada aturdidora al presionar abajo y ataque mientras se está fijando en un objetivo. Los objetivos principales de los niveles son eliminar enemigos. No se requiere recoger objetos, sin embargo, los pergaminos de ninjutsu son útiles, y algunos niveles requieren que Hotsuma destruya pilares de piedra para continuar. Shinobi también contiene funciones de combos. Una de estas funciones se llama "tate" kill, mediante la cual, si se matan enemigos en cadena, se reproducirá una escena en la que se eliminan todos los enemigos a la vez y se obtiene más Yin para tu hoja. La otra función es que, a medida que Hotsuma vence con su espada maldita "Akujiki", la espada cambiará de color, indicando diferentes multiplicadores de daño.