Nier Automata: The End of YoRHa Edition

La primera y segunda partida siguen las perspectivas respectivas de 2B y 9S durante una invasión inicial. Después de abrir una ruta para futuras misiones, son enviados a eliminar amenazas de máquinas para la Resistencia, dirigida por Anemone, quien les brinda apoyo. Durante sus misiones, 2B y 9S descubren que las máquinas están explorando las sociedades y conceptos humanos. Ambos trabajan con un grupo pacifista de máquinas liderado por Pascal; enfrentan a Adam y Eve, manifestaciones físicas de la red de máquinas que revelan que sus creadores fueron destruidos hace siglos, y encuentran a A2, un androide rebelde en fuga de YoRHa. Adam es asesinado por 2B tras capturar a 9S. Durante su recuperación, 9S descubre una falla en los servidores de YoRHa al sincronizarse con 2B y aprende que la humanidad se extinguió mucho antes de la invasión alienígena. Su último vestigio es un servidor en la Luna que contiene restos incompletos del genoma humano. YoRHa perpetúa el mito de su supervivencia para mantener la moral y ofrecer a los androides un "dios" por quien luchar. Con Adam muerto, Eve enloquece de dolor y lleva a las máquinas bajo su mando a un frenesí. 2B y 9S matan a Eve para detener la masacre, pero 9S queda infectado con un virus de lógica de Eve, obligando a 2B a matarlo. Sin embargo, la conciencia de 9S sobrevive dentro de la red de máquinas local. El tercer recorrido comienza cuando YoRHa lanza una invasión a gran escala. Un ataque de virus de lógica—habilitado por la "falla" que 9S descubrió previamente—corrompe todas las unidades de YoRHa, incluidas las del Bunker, salvo 2B y 9S, que ha sido restaurado. 2B y 9S se separan tras los hechos, y 2B está infectada con el virus de lógica. Descubierta por A2, 2B sube sus recuerdos a su espada y le pide que cuide de 9S. Un 9S ingenuo presencia a A2 matando misericordiosamente a 2B y jura venganza contra ella. Al mismo tiempo, una torre creada por las máquinas surge de la tierra, separando a los dos antes de que puedan pelear. La perspectiva se divide entre A2 y 9S unas dos semanas después de estos hechos. A2—la superviviente de una prueba de YoRHa—se encuentra empatizando con las máquinas; presencia la destrucción del pueblo de Pascal y luego que sus "niños" se suiciden por miedo al ser atacados. Pascal implora a A2 que borre su memoria o lo mate; A2 puede realizar cualquiera de las dos tareas o dejarlo. Un 9S cada vez más desbalanceado investiga las plataformas de recolección de recursos de la torre, enfrentándose a restos de máquinas y descubriendo que la torre está diseñada para lanzar un misil al servidor en la Luna. Finalmente, ambos ingresan a la torre, con Devola y Popola sacrificándose para abrirla.