Nicktoons Unite

El juego comienza con SpongeBob descubriendo que Plankton está tomando el control de Bikini Bottom con gigantescas máquinas de vacío. Goddard sale de un portal detrás de la casa de SpongeBob, y le muestra un mensaje de Jimmy Neutron. Siguiendo a Goddard a través del portal, se encuentra con Jimmy Neutron, Timmy Turner y Danny Phantom en el laboratorio de Jimmy. Jimmy cubre a SpongeBob con humedad auto-regeneradora para evitar que se deshidrate. Jimmy explica que su última invención, la Máquina del Portal del Universo, ha sido copiada por el Profesor Calamitous, quien ha formado un Sindicato con Plankton, Vlad Plasmius y Denzel Crocker, y ya están robando energía de sus mundos. Los héroes intentan teletransportarse a Casper High, pero llegan al castillo de Vlad, donde él revela que su portal de fantasmas está extrayendo energía de Ghost Zone, y ha capturado a los padres de Danny. Vlad golpea al grupo y los encierra en la Prisión de Ghost Zone. Al hacer amistad con Ghost Box, los héroes escapan tras vencer a Walker. Danny lleva a los héroes al portal de fantasmas de Fenton Works, donde conocen a Sam Manson y Tucker Foley. Al regresar al castillo, el grupo destruye los generadores del portal. Danny posee a su padre y usa sus Guantes Fantasma para golpear a Vlad, pero acaba escapando. Luego, los héroes viajan a Bikini Bottom, usando la goma de aire de Jimmy para respirar bajo el agua. Sandy Cheeks los envía a Jellyfish Fields para encontrarse con Patrick Star, pero es absorbida por un cosechador de medusas. Después de destruir los cosechadores, el grupo se encuentra en la nave del Holandés Voodoo. Danny lo persuade para que les deje ir a cambio de traer de vuelta a sus antiguos tripulantes. Al llegar al Chum Bucket, liberan a Patrick y a las medusas. En el tejado, luchan contra Plankton, quien pilota un cangrejo robótico gigante para rescatar al Sr. Cangrejo, y descubren que los villanos han estado extrayendo energía para alimentar una Máquina del Juicio Final. En Dimmsdale, los héroes infiltran y apagan la energía de la fortaleza dorada de Crocker. Luego se dirigen a Fairy World, donde encuentran a Jorgen von Strangle, liberan a las hadas y derrotan a Crocker, quien pilota un exoesqueleto en The Big Wand. El grupo regresa al laboratorio de Jimmy y conocen a Cindy Vortex. Jimmy se da cuenta de que Calamitous ha colocado un flea-bot en Goddard para espiarlo. Los héroes usan la máquina de encoger de Jimmy para reducirse y entrar en Goddard, vencer al flea-bot y hackearlo para localizar el escondite de Calamitous. Los héroes derrotan al Sindicato, y SpongeBob desconecta la Máquina del Juicio Final. Con Calamitous en prisión, Jimmy les da a los héroes cada uno un Neutronic Recaller en caso de futuros incidentes, y se separan.