Cave Story

El personaje del jugador despierta en una cueva sin recordar cómo llegó allí. Encuentra un pueblo de Mimigas, que están siendo perseguidos por el Doctor. Los sirvientes del Doctor, Misery y Balrog, buscan a Sue Sakamoto, una niña que ha sido transformada en un Mimiga. Al no encontrarla, abducen por error a otro Mimiga llamado Toroko. El jugador encuentra a Sue en el Egg Corridor, donde descubre los huevos de un Sky Dragon, que podrían permitirle escapar de la isla flotante si eclosionan. Sue intenta rescatar a su hermano Kazuma, pero King, el líder del Pueblo Mimiga, la captura y la culpa por el secuestro de Toroko. Sue encarga al jugador recuperar a Kazuma en Grasstown. Después de liberarlo, conocen al Profesor Booster, quien revela que el Doctor planea usar las flores rojas en los Mimigas para crear un ejército y conquistar el mundo superficial. Booster envía al jugador a la Sand Zone para destruir las flores rojas antes de que el Doctor las encuentre. Allí, el jugador conoce a Curly Brace, una robot femenina que también no tiene recuerdos de su pasado, y a Jenka, una anciana bruja que es madre de Misery y guardiana de las flores rojas. Jenka llama al personaje del jugador un “soldado de la superficie”, uno de los muchos enviados a la isla para acabar con los Mimigas. Misery transporta al jugador al Laberinto profundo dentro de la isla como castigo por interferir en los planes del Doctor. Curly Brace también ha sido enviada al Laberinto y cooperan para escapar. Balrog les ayuda a mover la roca que bloquea la salida, mostrando su amable naturaleza. La pareja encuentra y derrota al Core, una criatura mágica cuyo poder mantiene la isla flotando. Sin embargo, el Doctor interviene para salvarlo antes de que la isla colapse. Dependiendo de ciertas condiciones, el jugador puede salvar a Curly Brace, quien sacrificó su tanque de aire para salvar al personaje del jugador. Cuando regresa al Pueblo Mimiga, descubre que el Doctor ha capturado a los Mimigas. En el Egg Corridor, Kazuma le ofrece al jugador la opción de escapar de la isla con él usando un Sky Dragon, llevando a un final alternativo en el que el Doctor conquista el mundo superficial mientras Kazuma y el jugador se esconden en las montañas. El jugador puede optar por enfrentarse al Doctor y destruir el Core de la isla, lo que devolvería a los Mimigas a la normalidad. El jugador escala la pared exterior de la isla para llegar a la Plantación donde el Doctor usa a los Mimigas como mano de obra esclava para cultivar flores rojas. Los sirvientes del Doctor lo capturan y lo colocan en una celda con Sue. Ella es llevada antes de que el jugador despierte, pero su carta revela que el Doctor fue un miembro de la expedición de investigación que incluía a la familia de Sue y al Profesor Booster, pero él los traicionó al encontrar la Corona del Demonio. Sue le indica al jugador que busque a su madre, quien podría tener un plan para detener al Doctor. Si el jugador salvó a Curly Brace anteriormente, puede encontrar un objeto para restaurarle la memoria. Ella recuerda que el nombre del personaje del jugador es Quote, y que no eran los robots asesinos que masacraron a los Mimigas en el pasado. En cambio, fueron enviados a destruir la Corona del Demonio para que su poder no caiga en las manos equivocadas. Quote encuentra a la madre de Sue, Momorin, quien está construyendo un cohete que permitirá acceder a la parte superior de la isla donde reside el Doctor. Después de ayudarla a completar el cohete, Quote confronta a Misery y al Doctor. El Doctor ha purificado la esencia de las flores rojas en un cristal, que le permite sobrevivir incluso después de que Quote destruya su cuerpo. El espíritu del Doctor poseé el Core de la isla, pero Quote logra destruirlo también, causando que la isla comience a caer hacia la Tierra. Bajo ciertas condiciones, el jugador puede avanzar a una etapa extra llamada el Santuario Sangriento, donde está encarcelado Ballos, el creador de la Corona del Demonio. Ballos, hermano de Jenka, fue un poderoso mago que enloqueció tras ser torturado. Misery obligó a Ballos a crear la Corona del Demonio, pero ella y Balrog quedaron malditos para servir a quien la poseyera. Con la ayuda de Curly Brace, Quote derrota a Ballos y detiene la fuente de energía negativa que hacía que la isla cayera, salvando a sus habitantes. Balrog salva a ambos antes de que sean aplastados por la cárcel en colapso de Ballos —él fue enviado por Misery como agradecimiento por romper su maldición. Quote, Curly Brace y Balrog dejan la isla para vivir en paz.