Bowser Jr.'s Journey

Se ha añadido una nueva historia en Mario & Luigi: Bowser's Inside Story + Bowser's Journey. Esta nueva incorporación a la historia principal tiene a Bowser Jr. como el protagonista. Mientras Bowser está ocupado durante la historia principal, esta aventura sigue a Bowser Jr. en su misión para curar los blorbs él mismo, después de que estos hagan que numerosos secuaces se inflen hasta volverse inmóviles. A diferencia de su predecesor (Minion Quest: The Search for Bowser, incluido en Mario & Luigi: Superstar Saga + Bowser's Minions), no es necesario acceder a ella desde dentro de Bowser's Inside Story.