Rockman Zero 2

Ha pasado un año desde que Zero derrotó a Copy X. Desde entonces, ha pasado su tiempo vagando por el desierto derrotando ola tras ola de Pantheons. Cuando empieza el juego, Zero avanza cansado a través de una tormenta de arena envuelto en un manto rasgado. A medida que la arena disminuye, se da cuenta de que está siendo perseguido de nuevo por enemigos. Aunque está deteriorado, con armadura agrietada y armas rotas (su vara y escudo son inutilizables), su manto vuela con el viento y su escopeta Buster Shot se desenfunda en defensa. En otro lugar, los tres miembros supervivientes de los Cuatro Guardianes (Phantom se autodestruyó intentando detener el ataque de Zero en Area X en el juego anterior) asumieron el mando de Neo Arcadia, con Harpuia como líder. La muerte de Copy X fue encubierta, ya que los humanos lo veneraban como su salvador. Harpuia abandona Neo Arcadia y se encuentra con Zero tras su batalla en el desierto. Harpuia lo lleva a la nueva Base de la Resistencia, donde Zero es reparado y se reencuentra con Ciel y el resto de la Resistencia, además de conocer a su nuevo comandante, Elpizo. Solo en su oficina, Ciel le cuenta a Zero los cambios que han ocurrido durante el año en que estuvo desaparecido, y le recuerda su objetivo final de crear un nuevo sistema energético. Ella le muestra un Baby Elf, que es la base de su investigación actual.