Famicom Detective Club Part II

La escena del prólogo muestra una noche de otoño en la que un chico de 15 años (el protagonista del juego) huye de dos oficiales de policía. Un hombre, respetado por la policía, decide encargarse de la situación por sí mismo. El hombre lleva al chico a una cafetería, donde el niño explica que huyó del orfanato para buscar a sus padres. El hombre se presenta como un detective privado llamado Shunsuke Utsugi, y convence al niño de convertirse en su ayudante. Unos meses después, Utsugi y el protagonista reciben una llamada telefónica para revisar una escena del crimen. La víctima es una estudiante de primer año llamada Yoko Kojima. El protagonista empieza a recopilar información del Instituto Ushimitsu para resolver el caso de Yoko y vincularlo con el caso de Genjiro Kaneda, con la ayuda de dos amigas de la escuela, una llamada Ayumi Tachibana y un chico llamado Hitomi Kawaii. Pronto se descubre que Yoko estaba profundamente involucrada en una investigación sobre "El cuento de la muchacha que se queda atrás", un rumor que involucra a un espíritu de una chica ensangrentada que se aparece detrás de un estudiante, y el trío se embarca en la búsqueda de la verdad tras ese rumor.