Pokemon Puzzle Collection

Le joueur peut choisir parmi une sélection de différents types de puzzles. Au début, les seules options sont Puzzle Shadow, Puzzle Motion et Mission de Sauvetage, mais après avoir complété 30 puzzles, une quatrième variété, Power On, est débloquée. Il y a 20 puzzles pour chaque type, répartis en cinq niveaux, avec quatre puzzles par niveau. Plus un puzzle est avancé dans le niveau, plus il est difficile. Une fois qu'un puzzle est résolu, le Pokémon impliqué est ajouté au Pokédex du jeu, le Minidex.