Nier Automata: The End of YoRHa Edition

Les premières et deuxièmes parties suivent la perspective respective de 2B et 9S lors d'une invasion initiale. Après avoir ouvert une voie pour de futures missions, ils sont envoyés éliminer les menaces machines pour la Resistance, dirigée par Anemone, qui leur apporte son soutien. Pendant leurs missions, 2B et 9S découvrent que les machines explorent les sociétés et concepts humains. Ils collaborent avec un groupe de machines pacifistes dirigé par Pascal ; affrontent Adam et Eve, manifestations physiques du réseau de machines qui révèlent que leurs créateurs ont été détruits il y a des siècles, et rencontrent A2, un androïde rebelle en fuite de YoRHa. Adam est tué par 2B après avoir capturé 9S. Pendant sa convalescence, 9S découvre une faille dans les serveurs de YoRHa lors de la synchronisation avec 2B, et apprend que l'humanité a été exterminée bien avant l'invasion extraterrestre. Leur dernier vestige est un serveur basé sur la Lune contenant les restes incomplets du génome humain. YoRHa perpétue le mythe de leur survie pour maintenir le moral et donner aux androides un « dieu » pour lequel se battre. Avec Adam mort, Eve devient fou de douleur et entraîne les machines sous son commandement dans la folie. 2B et 9S tuent Eve pour mettre fin à la folie, mais 9S est infecté par le virus logique d'Eve, contraignant 2B à le tuer. Cependant, la conscience de 9S survit dans le réseau de machines local. La troisième partie commence alors que YoRHa lance une invasion à grande échelle. Une attaque par virus logique—activée par la « faille » que 9S a précédemment découverte—corrompt toutes les unités YoRHa, y compris celles du Bunker, sauf 2B et le 9S restauré. Après leur séparation, 2B et 9S sont séparés, et 2B est infectée par le virus logique. Repérée par A2, 2B télécharge ses souvenirs dans son épée et lui demande de veiller sur 9S. Un 9S ignorant assiste à l’euthanasie de 2B par A2 avec compassion, et jure de se venger. En même temps, une tour créée par les machines s'élève du sol, séparant les deux avant qu'ils ne puissent se battre. La perspective se divise entre A2 et 9S deux semaines après ces événements. A2—la survivante d’un essai de YoRHa—se sent empathique envers les machines ; elle assiste à la destruction du village de Pascal, puis au suicide de ses « enfants » par peur lors d'une attaque. Pascal supplie A2 de soit effacer sa mémoire, soit de le tuer ; A2 peut effectuer l’une ou l’autre ou le laisser. Un 9S de plus en plus perturbé enquête sur les plateformes de collecte de ressources de la tour, combattant des restes de machines et découvrant que la tour est conçue pour lancer un missile vers le serveur de la Lune. Tous deux entrent finalement dans la tour, avec Devola et Popola se sacrifiant pour l’ouvrir.