Star Wars Republic Commando

À la suite d'un montage qui retrace brièvement la création du Delta Squad, sa jeunesse et sa formation dans les installations de clonage de Kamino, le jeu commence avec la déploiement de l'équipe en première ligne lors de la Bataille de Geonosis, au début de la Guerre des Clones. Là, le chef d'équipe Delta-38 ("Boss", le personnage du joueur) retrouve ses coéquipiers 62, 40 et 07 ("Scorch", "Fixer" et "Sev" respectivement) alors qu'ils reçoivent leur première mission : assassiner Sun Fac, le principal lieutenant du Pion Poggle le Moindre, un des membres du Conseil séparatiste. Après avoir mené à bien leur objectif, le Delta Squad sabote l'usine à droids sous le siège de Sun Fac, désactive un casernement antiaérien qui fait rage contre les forces aériennes de l'Armée de la République, et s'infiltre à bord d'un vaisseau mère Lucrehulk de la Fédération du Commerce séparatiste pour voler des codes de lancement importants afin d'empêcher la flotte séparatiste de fuir, s'échappant juste avant que le vaisseau ne soit détruit. Un an après le début de la guerre, le Delta Squad, désormais expérimenté, est envoyé enquêter sur le vaisseau d'assaut républicain en débris, le Prosecutor, leur ancienne base avant leur déploiement actif. Le Delta Squad se divise pour enquêter, perdant rapidement contact avec le commandement en montant à bord du vaisseau. En progressant à l’intérieur, l’équipe trouve le Prosecutor apparemment abandonné et en mauvais état. Le squad perd contact avec Scorch après qu’il ait signalé une interférence électrique avec son visor, et Boss est bientôt pris en embuscade par des droïdes chasseurs. Boss se dirige vers l’un des noyaux de données du vaisseau pour retrouver Sev, mais il est soudainement attaqué et capturé par un Trandoshan, membre d’un large équipage d’esclavagistes et de mercenaires qui ont pris le contrôle du vaisseau. Après avoir évité la capture, Boss et Fixer se retrouvent, mais sont rapidement attaqués par des droïdes de combat déployés par les Trandoshans. Après avoir sauvé leurs coéquipiers captifs, le Delta Squad reprend le pont du vaisseau et détruit un dispositif de brouillage, ce qui rétablit la communication avec le commandement. Il devient clair que les Trandoshans ont l’intention de vendre le vaisseau aux Séparatistes en échange de distributeurs de droïdes de combat. En se rendant aux hangars, le Delta Squad détruit alors le dropship Trandoshan lors de leur retraite. Immédiatement après, un vaisseau de la Fédération du Commerce de classe Lucrehulk sort d’hyperspace. Alors que des renforts de la République approchent, le Delta Squad doit défendre le vaisseau contre des hordes de droïdes de combat. Après avoir repoussé avec succès la force ennemie, le vaisseau de bataille séparatiste commence à tirer sur le Prosecutor. Le Delta Squad se fraye un chemin jusqu'au pont d'armement pour activer les lasers turbo du vaisseau afin de se défendre. L'arrivée de justesse d’un second vaisseau républicain, le RAS Arrestor, permet à l’équipe d’avoir assez de temps pour activer les lasers turbo, détruisant finalement le vaisseau de bataille séparatiste et mettant hors service tous les droïdes de combat restants à bord.