Code 18

Le jeu débute le 11 septembre 2018. Lorsque Hayato s'apprête à tester son pack de vol "Dragon Unit" sur le toit de l'école, une fille tombe du ciel, portant un dispositif similaire. Il tente de la sauver, mais chute à son tour et meurt ; après cela, il est transporté dans le passé sans aucun souvenir de l'événement, et parvient à la sauver. Elle s'appelle Arika Tokitou. L'Académie Ryuusei et le Second Science Club se préparent pour un festival scolaire prévu dans un mois, lorsque le professeur de sciences de Hayato, Genkuro Kanbara, lui donne une puce pour smartphone contenant une "Pierre d'Agastia", qui pourrait théoriquement lui permettre de recevoir des messages vocaux venant du futur. Il l'installe et commence à recevoir des messages du futur, mais ne peut pas comprendre ce qu'ils disent. À un moment, à cause d'un accident avec le Dragon Unit, la maison de Hayato explose, l'obligeant à dormir dans la salle du club scientifique. Lui et les autres membres décident que, pour le festival, ils doivent faire une performance en direct pour Hikari. Pendant ce mois, Hayato et Hikari se rapprochent, et il emménage avec elle. Il l'aide à surmonter ses problèmes d'estime de soi et à réussir la performance, et ils deviennent un couple. À la fin du festival, le temps revient en arrière au 11 septembre ; le même mois se répète plusieurs fois, Hayato étant inconscient de ces boucles et n'ayant aucun souvenir des précédentes. À chaque boucle, il s'investit pleinement auprès d'un des personnages féminins du jeu, les aide avec le festival et à résoudre leurs problèmes personnels. Bien qu'au début Arika soit distante, elle commence à s'attacher à Hayato à mesure que les boucles se succèdent. Après plusieurs répétitions, Hayato revient au 11 septembre avec ses souvenirs intacts, et réalise qu'Arika est la seule à sembler liée à cette boucle temporelle. Il l'affronte, et si elle avoue avoir un lien avec cela, elle ne lui fait pas confiance pour l'aider. Lorsque Hayato comprend que sa maison va exploser avec Hikari et Arika à l'intérieur, il les sauve au lieu de sauver le Dragon Unit ; cela lui vaut la confiance d'Arika, qui lui avoue être une voyageuse temporelle venue de 2040. Apprenant que sa présence a causé cette boucle, elle souhaite revenir dans son époque, mais ne peut pas car sa machine à voyager dans le temps est cassée. Hayato rassemble des pièces pour la réparer, et se rapproche à nouveau de Hikari. Il découvre que la véritable identité d'Arika est Akari Hino, et qu'elle est la fille de Hayato et Hikari venant du futur. Dans le futur, Hayato était devenu un working addict, construisant une machine à voyager dans le temps tout en négligeant Hikari et Akira ; furieux, Akira lui a volé la machine pour voyager en 2018. Moyennant la gravité zéro pour faire fonctionner la machine, ils la combinent avec le Dragon Unit et l'emmènent à la Sky Tower, haute de 1 200 pieds. Leur trajet est entravé par un tremblement de terre, mais ils parviennent à l'atteindre avec l'aide de Hikari, Tamaki, Yuzu, Nanari et du professeur Kanbara. Il est révélé que l'expéditeur des messages vocaux du futur est Hayato 2040 ; comme les versions futures de Hayato et Hikari avaient vu Akari en 2018, ils savaient qu'ils devaient recréer ces événements pour éviter une paradoxe temporelle qui ferait disparaître Akari. Ainsi, Hayato a passé tout son temps à créer une machine à voyager dans le temps en 2040, tout en étant froid envers Akari pour l'inciter à voyager vers le passé. Le Hayato de 2040 lui a alors envoyé des messages vocaux pour le guider et créer un paradoxe ontologique garantissant la survie d'Akari. Akari retourne en 2040, rompt la boucle, et retrouve ses parents.