Super Godzilla

Lorsque King Ghidorah attaque soudainement Osaka, l'armée déploie le Super X II pour localiser Godzilla, utilisant un transmetteur pour contrôler le dinosaure mutant. Godzilla est guidé vers Osaka, où il combat et tue King Ghidorah. Immédiatement après, le corps de Ghidorah disparaît et un vaisseau spatial alien apparaît. Les envahisseurs révèlent qu'ils contrôlaient Ghidorah, et exigent que l'humanité se rende. Pendant ce temps, un autre Godzilla apparaît au mont Fuji, et le Super X II l'attire sur place pour l'affronter. Godzilla confronte ce nouveau Godzilla, qui se révèle être Mechagodzilla portant une peau artificielle. Lors du combat contre le robot, les extraterrestres kidnapent le Dr. Shiragami et l'emmènent au lac Ashino. Godzilla s'y rend pour sauver le professeur, et est confronté à Biollante, son clone végétal. Après avoir vaincu Biollante, le Super X II sauve Shiragami, découvrant que le docteur avait récupéré des échantillons d'ADN de Godzilla et Ghidorah et mené des expérimentations pour créer un sérum améliorant les attributs physiques de n'importe quelle créature. Cependant, les extraterrestres ont envahi son laboratoire et volé les échantillons, qu'ils ont utilisés pour créer Biollante. Le Dr. Shiragami injecte une partie du sérum à Godzilla, le rendant plus puissant. Les aliens libèrent Battra à Yokohama, qui dépose un œuf menaçant d'éclore. Godzilla se rend à Yokohama, tue Battra, et détruit l'œuf avant qu'il n’éclose. Soon, King Ghidorah revient sous la forme de Mecha-King Ghidorah, ressuscité par les extraterrestres, et commence à attaquer Yokohama. Ces derniers révèlent avoir dissimulé plusieurs capsules dans la ville contenant le sérum de Shiragami. Si Godzilla parvient à toutes les trouver avant que Mecha-King Ghidorah ne détruise la moitié de la ville, il se métamorphosera en une forme plus puissante. Il réussit, affronte Mecha-King Ghidorah. Le monstre cyborg est facilement surpassé par la nouveau pouvoir de Godzilla, qui le détruit. Cependant, la bataille n’est pas finie. Les extraterrestres se rendent en Chine, où ils réveillent une ancienne créature appelée Bagan et l'injectent avec un échantillon du sérum, le rendant aussi puissant que Godzilla. Les deux titans s'affrontent dans les ruines de Yokohama, Bagan s'avérant plus difficile que tous les autres monstres rencontrés. Finalement, Godzilla vainc Bagan, et les extraterrestres battent en retraite, mais en promettant leur revanche. Le sérum finit par s'estomper, et Godzilla retrouve sa forme originale. Le Super X II désactive le transmetteur, libérant Godzilla de leur contrôle, et le dinosaure mutant retourne dans l'océan, l'humanité lui étant redevable pour son aide.