Godzilla

En 1954, Godzilla attaque le Japon. Suite à son attaque, l'humanité découvre et exploite la G-Énergie, une source d'énergie prélevée sur Godzilla. Soixante ans plus tard, Godzilla réapparaît pour se nourrir de la G-Énergie. Godzilla progresse à travers le Japon, repoussant des Kaiju apparemment attirés par lui et détruisant des G-Generators. L'humanité recueille des informations sur Godzilla, et il est révélé que depuis sa première attaque, la G-Force construit un robot ressemblant à Godzilla. Une fois toutes les données collectées, le robot est déployé. Il peut s'agir de Super Mechagodzilla ou de Kiryu, selon la difficulté choisie par le joueur. Godzilla terrasse le robot, puis détruit les deux derniers générateurs. Godzilla semble alors repartir vers la mer. Cependant, l'énergie qu'il a absorbée le pousse à atteindre une masse critique et à se transformer en Burning Godzilla. On suppose qu'il va exploser et détruire le monde. L'opérateur de la G-Force suggère de le geler, et des cuves de refroidissement sont envoyées. Le Super X3 arrive, mais est endommagé. Peu après, un autre Godzilla apparaît, mais est également vaincu. Le Gotengo et le Super X3 parviennent à geler Godzilla, et Kiryu le transporte en mer. Les deux sombrent dans l'océan, et l'humanité commence à se reconstruire.