Aquanaut's Holiday

Le mode histoire du jeu peut être comparé à un jeu d'aventure. Le personnage principal — dont le nom n'est pas mentionné — est un journaliste à la recherche de l'océanographe disparu William "Bill" Graber. À bord du sous-marin Dolphin no.2, vous explorez les mers à la recherche d'indices. Le jeu se déroule à Kisira Atoll, en Polynésie. Une station de recherche océanographique nommée Kisira Base est le point de départ et de retour constant, où vous pouvez vous ravitailler (notamment en batteries pour les balises sonars de navigation) et faire le plein d’équipements. Deux scientifiques travaillent à la base : la jeune et rêveuse Jessica Porter et le conservateur en chef Robert Kemelman. Tous deux vous assistent dans la résolution des mystères, chacun à leur manière. Jessica aime croire aux contes de fées et légendes, tandis que Robert propose généralement des explications scientifiques. Tous les poissons, animaux et autres découvertes sont enregistrés dans une base de données. Certains poissons peuvent communiquer, et le joueur doit reproduire les sons émis par un poisson en utilisant les quatre boutons de la manette Sixaxis. À tout moment, la zone de la carte déverrouillée est accessible pour l'explorer à sa guise.