Fullmetal Alchemist Broken Angel

Situé entre les épisodes 17 et 18 de l'anime, le jeu commence avec les frères Elric (escortés de manière quelque peu involontaire par le Major Alex Louis Armstrong) en route vers Central City par le train. Pendant qu'Ed se plaint, Al le console, et Armstrong se vante, le train est soudainement attaqué par des terroristes. La skirmish se termine finalement avec un train détruit et les frères dans la ville de New Heissgart, cherchant un moyen de rejoindre Central. Là, ils rencontrent une fille nommée Armony et en apprennent davantage sur le Philosopher's Catalyst, un objet presque aussi puissant que la Pierre Philosophale elle-même, mais utilisé pour accroître l'efficacité de l'alchimie. Le Philosopher's Catalyst semble directement lié aux chimères berserk qui se baladent, à la force militaire rebelle, et à la réunion des alchimistes en ville. Les Elric découvrent rapidement que leur simple mission de prendre un train devient beaucoup plus complexe en apprenant l'existence du Catalyst et les mystérieuses ténèbres qui l'entourent.