X-Men Legends II: Rise of Apocalypse

Le jeu commence avec les X-Men et la Confrérie des Mutants unissant leurs forces pour sauver le Professeur X et Polaris. Cyclope, Tornade et Wolverine rencontrent Magneto, Mystique et Sabretooth dans une base-prison militaire au Groenland pour libérer le Professeur X. Après l'avoir libéré, les équipes se déplacent vers le havre mutant fictif de Genosha. Elles découvrent l'île ravagée par les forces d'Apocalypse, où elles rencontrent brièvement Mister Sinister, qui expérimentait sur des mutants de Genosha, et combattent Abyss, Lady Deathstrike et Zealot. Les X-Men traversent les débris et découvrent ce qu'il cherchait. Ils apprennent que Quicksilver a été enlevé par Apocalypse, qui a égalementKidnappé Beast de l'X-Mansion. Beast réussit à indiquer la direction du Savage Land, une réserve préhistorique secrète en Antarctique. Les équipes progressent à travers le Savage Land, retardant temporairement les plans d'Apocalypse tout en affrontant Grizzly, Garokk, Mikhail Rasputin et Sauron. Puis, Apocalypse se rend à New York pour la conquérir. Les équipes aident Nick Fury à reprendre le contrôle des Sentinelles de Bastion, sabotent l'armée et les ressources d'Apocalypse, et battent Holocaust, les Stepford Cuckoos, Stryfe et Deadpool contrôlé mentalement, mais Emma Frost et Angel sont également enlevés. Angel est involontairement transformé par Apocalypse et Mister Sinister en Archangel, un Horseman d'Apocalypse. Il est assigné comme sentinelle à la tour d'Apocalypse. Les équipes battent Archangel et infiltrent la tour où elles retrouvent Beast, désormais sous le contrôle de Mister Sinister. Ce dernier kidnappe Sabretooth et s'enfuit avec Apocalypse et Sinister en Égypte. Ils découvrent que le plan d'Apocalypse consiste à utiliser Polaris, Quicksilver, Emma Frost et Sabretooth — quatre mutants dotés de ce qu'il appelle un ADN Harmonique — comme composantes d'une machine pour alimenter une expérience qui lui donnera une puissance immense. Les équipes suivent alors Apocalypse en Égypte, où elles battent Mister Sinister tout en libérant Beast du contrôle de Sinister. Après avoir vaincu le dernier gardien, Living Monolith, elles affrontent Apocalypse et le battent en lui volant les pouvoirs de sa machine. Dans la scène finale, Magneto et Professeur X se quittent à nouveau en tant qu'adversaires, notant qu'Apocalypse a été vaincu mais pas détruit. Beast se demande pourquoi la machine n'a pas fonctionné correctement, se demandant si une sabotage aurait été un facteur. Alors que le X-Jet s'envole, Sinister apparaît sur la pyramide, riant, laissant entendre qu'il a saboté la machine.