Teenage Mutant Hero Turtles II: Back From the Sewers

Similaire à Fall of the Foot Clan, le précédent jeu Game Boy de la série, le joueur peut alterner entre les turtles avant chaque niveau. Chaque tortue a ses propres forces et faiblesses. Donatello possède une longue portée d'attaque, mais attaque lentement, Raphael est rapide mais à très courte portée, et Leonardo ainsi que Michelangelo sont équilibrés. Lorsqu'une tortue est vaincue, elle est capturée par l'ennemi. Le jeu se termine lorsque toutes les tortues sont capturées. Après avoir terminé un niveau, le joueur a la possibilité de sauver une tortue capturée. Si aucune tortue n’a été capturée, il accède à un niveau bonus à la place. Le jeu propose plusieurs éléments de gameplay en plus des beat'em up classiques, comme éviter d'énormes rochers dans les niveaux souterrains, se déplacer en skate ou escalader des plates-formes aériennes, et le jeu passe d’une simple vue 2D où l’on marche de gauche à droite à une zone plus ouverte où les tortues peuvent se déplacer librement sur tout l’écran. Les boss du jeu sont les méchants standards : Bebop et Rocksteady, Baxter Stockman, le Général Traag, Granitor Le Guerrier de Pierre, Krang, Shredder et Super Shredder. Comme dans Fall of the Foot Clan, Krang sert de boss final. Le jeu possède plusieurs niveaux de difficulté qui, selon le choix, font apparaître des ennemis plus puissants ou donnent même aux boss des attaques supplémentaires.