Famicom Detective Club Part II

La scène du prologue se déroule une nuit d'automne alors qu'un garçon de 15 ans (le protagoniste du jeu) fuit deux policiers. Un homme, respecté par la police, décide de s'occuper de la situation lui-même. Il emmène le garçon dans un café, où celui-ci explique avoir fugué de son orphelinat pour retrouver ses parents. L'homme se présente comme un détective privé nommé Shunsuke Utsugi, et persuade le garçon de devenir son assistant. Quelques mois plus tard, Utsugi et le protagoniste reçoivent un appel téléphonique pour vérifier une scène de crime. La victime est une élève de première année, Yoko Kojima. Le protagoniste commence à recueillir des informations au lycée Ushimitsu pour résoudre l'affaire Yoko et la relier à celle de Genjiro Kaneda, avec l’aide de deux amis de Yoko, une fille nommée Ayumi Tachibana et un garçon nommé Hitomi Kawaii. Il apparaît rapidement que Yoko enquêtait sur "Le Conte de la Fille qui se tient derrière", une rumeur impliquant le fantôme d'une fille ensanglantée qui se tient derrière un élève, et le trio se met en quête de découvrir la vérité derrière cette rumeur.