Kingdom Hearts II Final Mix [Limited Edition]

In settembre 2006, Square Enix annunciò Kingdom Hearts II Final Mix, con nuove scene e elementi di gameplay. Come la prima riedizione, questa versione avrebbe combinato l'audio in inglese con i sottotitoli in giapponese e avrebbe utilizzato la canzone "Sanctuary" invece di "Passion". Le nuove scene, tuttavia, erano doppiate in giapponese, poiché mostrano principalmente membri dell'Organizzazione XIII da Kingdom Hearts: Chain of Memories, che all'epoca non avevano ancora doppiatori inglesi; queste scene furono poi ridoppiate in inglese per la versione HD 2.5 Remix.