Metal Gear Acid

Im Jahr 2016 wird ein Jumboflugzeug, das Senator Hach, einen wichtigen Politiker und vermutlich zukünftigen Präsidentschaftskandidaten, transportiert, von Terroristen entführt. Im Austausch für den Senator fordern die Terroristen vom US-Regierung Pythagoras, ein Forschungsprojekt, das in der Moloni-Republik im südlichen Afrika durchgeführt wird. Um diese Terroristen zu identifizieren, beginnt die Regierung eine Untersuchung des Pythagoras-Projekts. Die Moloni-Regierung verweigert die Zusammenarbeit mit den USA und erklärt, dass sie keine Eingriffe in ihre aktuellen Angelegenheiten wünschte. Als Reaktion darauf schickt die USA ein verdecktes Spezialkräfteam, um den Fall zu untersuchen, doch dieses wird durch bewaffneten Widerstand vernichtet. Angesichts fehlender Alternativen und der tickenden Uhr ruft die US-Regierung Solid Snake, um in das Labor einzudringen, die Natur von Pythagoras zu entdecken und Senator Hach zu retten.