Tenchu: Wrath of Heaven

Nachdem Lord Mei-Oh in Tenchu: Stealth Assassins besiegt wurde, blieb Rikimaru in Lord Mei-Oh's Festung zurück, trug einen riesigen Felsen, um einen Fluchtweg für Ayame und Prinzessin Kiku zu schaffen. Es scheint, als wäre er gefangen und für tot gehalten worden. Ayame steckte Rikimaru's Schwert, „Izayoi“ (das er im Opening-CG von Wrath of Heaven zieht), im Schnee als Denkmal für ihren Schulterkameraden, der nun für tot gilt. Ein Jahr später berichtet Rikimaru Lord Gohda, dass er diese Beinahe-Todeserfahrung überlebt hat; unbekannt für sie ist jedoch, dass der echte Rikimaru in der 20. Jahrhundert gefangen ist und versucht, einen Weg zurück in ihre Zeit zu finden. Die Handlung des Spiels verläuft je nach gewähltem Charakter unterschiedlich, verbindet sich aber an bestimmten Punkten. Die Geschichte dreht sich hauptsächlich um Rikimaru’s Rückkehr und den Kampf um die Drei Juwelen, die angeblich Macht verleihen denen, die sie besitzen. Dabei handelt es sich um die Juwelen des Himmels, der Erde und der Tugend. Tenrai, ein böser Zauberer, der die Juwelen in seine Hände bekommen will, befiehlt seinen Mannen, die Juwelen von ihren Besitzern zu stehlen. Doch als er auf Rikimaru trifft, zeigt er Interesse an seiner Macht und versucht, ihn für seine Seite zu gewinnen. Rikimaru lehnt ab und bekämpft zusammen mit Ayame jeden einzelnen von ihnen. Einer von Tenrais Anhängern ist Onikage, der ihm nur dient, um seinen Plan zu verfolgen, Mei-Oh (seinen ehemaligen Meister) und Tatsumaru (den ehemaligen Anführer des Azuma Ninja Clans, den Tenrai wiederbelebt hat) wieder zum Leben zu erwecken. Rikimaru und Ayame folgen Tenrai in seine Festung, um zu verhindern, dass er die Welt durch die Macht zweier Juwelen zerstört. Wenn er besiegt werden kann, kehrt der Frieden in Gohdas Land zurück.