Teenage Mutant Ninja Turtles 3 Mutant Nightmare

In Episode 1 beginnen die Turtles damit, eine alte Person in New York City vor sadistischen Triceratons zu retten. Nachdem sie drei Träger zerstört haben, die die Triceraton-Armee ausliefern, gehen die Turtles unter die Erde, um den Central Park zu erreichen und ihre Freunde Casey und April zu befreien. Während sie im Park sind, verteidigen Leo, Raph, Mikey und Don gegen die Triceratons und Professor Honeycutt, der als Fugitoid aus TMNT 2 Battle Nexus bekannt ist, unterstützt die Turtles dabei, herauszufinden, wo Casey Jones und April O'Neil gefangen gehalten werden. Beim Eindringen in die Basis der Triceratons, Zaranmon, den Oberbefehlshaber der Triceraton, aktiviert einen Roboter, um die Turtles und Traximus aufzuhalten. Zaranmons Versuch scheitert, und Traximus zerstört einen Stuhl, um einen Wandel in ihrem Clan herbeizuführen. In Episode 2 entdecken die Turtles neue Technologien von Baxter Stockman, während Mousers die Kanalisation infiltrieren und Master Splinter heftige Ohrenschmerzen bereiten. Während sie ihren Sensei beschützen, wehren die Ninja Turtles die Mousers ab und bleiben in seiner Nähe. Doch Master Splinter wird gefangen genommen, und die Turtles verwenden im Hovercraft, um einen Lieferwagen zu verfolgen. Sie werden bald von einem großen und einem kleinen Gegner-Duo für einen Hinterhalt blockiert. Nachdem sie diese überwunden haben, setzen die Turtles ihre Rettungsmission für Master Splinter fort und kämpfen schließlich gegen Bishop, wobei sie Wurfsterne verwenden, um ein Schloss zu knacken und ihn zu befreien. In Episode 3 begegnen die Turtles allen Mitgliedern des Foot Clan durch die Missionen. Hun, Karai und Oroku Saki, die menschliche Identität des Shredder, fallen den Turtles zum Opfer. Im Kampf gegen Saki wird er zu Mega Shredder aufgerüstet. Die Ninja Turtles besiegen ihn und werden dann zum Tribunal vor den Utrom-Rat gerufen. Scherel, der Utrom, der Shredders Körper kontrolliert, wird wegen hinterhältiger Verbrechen angeklagt und ins eisige Planet verbannt, während Karai und die anderen den Behörden übergeben werden, bevor das Hauptspiel endet. Im Nightmare-Kapitel hat jeder der Turtles einen Traum und begegnet verschiedenen Bossen. Das Abschließen der meisten Missionen in diesem Kapitel führt zum Endgegner des Spiels, Ultimate Drako. Um die Gembu-Schriftrollen zu verwenden und die ultimativen Turtle-Formen zu aktivieren, muss der Spieler Schriftrollen und andere Inhalte im Free Battle-Modus sammeln.