SpongeBob SquarePants Battle for Bikini Bottom

Das Spiel dreht sich um das Thema, dass Roboter Bikini Bottom, die Heimatstadt von SpongeBob, überfallen. Die Roboter wurden von Plankton, dem bösen genialen Besitzer des Chum Bucket, erschaffen, der eine neue Maschine namens Duplicatotron 3000 gebaut hat, um eine Armee von Robotern zu produzieren, die die Welt erobern sollen. Doch nachdem er sie erschaffen hat, merkt er, dass der Schalter am Duplicatotron versehentlich auf "Nicht Gehorchen" gestellt wurde, und die Roboter stoßen ihn schnell aus dem Chum Bucket, bevor sie die Kontrolle übernehmen. SpongeBob und Patrick spielen mit Spielzeugrobotern und wünschen sich, echte Roboter zu haben. Patrick nutzt seine "magische Wunschröhre", um ihren Wunsch wahr werden zu lassen, in der Hoffnung, dass die Roboter morgen erscheinen. SpongeBob wacht auf und findet sein Haus verwüstet vor, nachdem er gedacht hatte, er wolle mit einem Roboter spielen. Er wandert eine Weile durchs Haus und erhält ein Fax von Mr. Krabs, der ihm sagt, dass er SpongeBob für jeden bestimmten Betrag glänzender Gegenstände, den er sammelt, eine goldene Spatel geben wird. Draußen findet SpongeBob einen enttäuschten Plankton, der ihm eine Lügengeschichte erzählt, dass die Roboter aus dem Nichts auftauchten und ihn rauswarfen. Täuscht von dem kleinen Bösewicht macht sich SpongeBob auf eine gefährliche Mission, um goldene Spatel zu finden, die Roboter loszuwerden, glänzende Gegenstände an Mr. Krabs zu tauschen, um goldene Spatel zu bekommen, Patrick bei der Suche nach seinen gestohlenen Socken (die von den Robotern weggenommen wurden), die er gegen zehn Socken zurückbekommen kann und Plankton wieder ins Chum Bucket zu bringen, inklusive Bungee-Jumping, Blasenkunst, das Erlernen neuer Blasetechniken von Bubble Buddy und Reisen durch Träume unter anderem.