Aleste 2

Il gioco si svolge nel 2039, due decenni dopo che il supercomputer DIA51 attaccò e decimò la Terra. Dopo un lungo periodo di ricostruzione, la Terra viene invasa da una razza di umani-alieni simili a piante chiamata Vagand, intenti a trovare una nuova fonte di cibo sul nostro pianeta. Nel loro primo attacco sulla Terra, i Vagand distruggono una navetta spaziale terrestre comandata dall'eroe precedente, Ray Waizen. Il loro piano di invadere la Terra viene contrastato dalla versione più recente dell'Aleste, pilotata dalla figlia di Ray e Yuri Waizen, Ellinor, che ha giurato di vendicare la morte del padre e di uccidere personalmente il capo dei Vagand, Gaizel.