World Soccer Jikkyou Winning Eleven 3: Final Ver.

La versione giapponese, Winning Eleven 3 è stata ripubblicata nel 1999 come Winning Eleven 3: Final Ver.. Le principali modifiche e miglioramenti si sono concentrati su aggiornamenti grafici e statistici piuttosto che sul motore stesso. Le differenze più significative rispetto all'originale sono: L'aspetto complessivo del gioco è meno vivido per aumentare il livello di realismo. Alcuni kit di casa, trasferta e portieri sono stati aggiornati (inclusi i team All Star). L'aspetto dei gol e delle reti è stato modificato. Le squadre sono state aggiornate per riflettere esattamente le squadre della Coppa del Mondo FIFA 1998, il numero di giocatori nelle formazioni è stato esteso a 22. Tre livelli di difficoltà invece di cinque: facile, medio e difficile. La scelta della durata della partita è stata ampliata a 30 minuti in spazi di 5. Le impostazioni della partita nella Modalità Esibizione ora includono la scelta delle divise, un periodo esteso, rigori e gol d'oro. Durante la Modalità Coppa sono state aggiunte le statistiche di gol e assist. L'imitazione dello Stade de France, sede della finale della Coppa del Mondo FIFA 1998, è stata aggiunta come nuovo stadio. Le ripetizioni immediate dopo i momenti più interessanti come tiri sbagliati, falli o fuorigioco sono state implementate durante la partita. Le modifiche più evidenti durante il gioco riguardano il sistema di tiro migliorato e l'aggiunta della barra di potenza durante i calci d'angolo. È stato aggiunto un nuovo metodo di passaggio uno-due, che consente al primo giocatore di passare e correre senza che il secondo giocatore debba restituire immediatamente la palla. Questa nuova mossa ha aggiunto molta più varietà al gioco.