Poiché questo gioco è ambientato nell'anno 2097, secondo la sequenza introduttiva, una sezione fornisce anche la storia dell'ambientazione del gioco: nell'anno 2057 l'esaurimento delle risorse della Terra coincise con un'espansione dell'esplorazione spaziale. Dopo una guerra catastrofica per risorse sempre più scarse, conclusa dieci anni prima degli eventi di G-Police, i governi della Terra persero il potere militare. Di conseguenza, potenti corporazioni avevano esercitato il controllo sulla Terra e sulle colonie spaziali in crescita. La Polizia Governativa (G-Police) fu formata dal rimanente governo di coalizione della Terra per mantenere l'ordine in queste colonie. Nella seconda parte della sequenza introduttiva, Slater, il protagonista del gioco, si presenta come un veterano di guerra che si era unito alla G-Police per condurre la propria indagine sul presunto suicidio di sua sorella Elaine, sospettando che sia stata uccisa. Espone inoltre la sua visione della G-Police, affermando che manca di autorità e che «chiudono un occhio» verso «affari aziendali loschi», mentre cercano di mantenere l'ordine. Li descrive le Havoc gun-ships come obsolete e i piloti come una miscela di veterani di guerra disperati e idealisti ingenui. L'azione si svolge in un contesto urbano futuristico, talvolta illustrato da cut-scene. I primi livelli del gioco mostrano Slater mentre combatte contro bande nemiche. La G-Police sospetta che la corporazione «Krakov» fornisca alle bande armamenti. Il presidente di Krakov, tuttavia, è successivamente oggetto di un tentativo di assassinio da parte delle bande. Durante questo tentativo, Hiroshi Tachikawa — un pilota che Slater descrive come colui che pilotava la sua gun-ship «come se fosse nato per farlo» — muore quando la sua gun-ship si schianta dopo un misterioso malfunzionamento. Per motivi di morale, la natura della sua morte viene insabbiata; Slater nota che questo incidente ricorda la morte di Elaine. Dopo numerose insurrezioni, invasioni e atti di terrorismo ai danni del proprio personale e delle proprietà, Krakov incolpa una rivale corporativa, «Nanosoft», e inizia ad attaccarli apertamente con il proprio esercito privato. Non avendo prove di coinvolgimento con le bande criminali, la G-Police protegge Nanosoft, distruggendo infine il potere militare di Krakov. La G-Police, tuttavia, indaga esattamente sul perché Krakov e Nanosoft stessero combattendo. La seconda metà del gioco ritrae un conflitto tra la G-Police e le forze private di Nanosoft, che attaccano la G-Police dopo il crollo di Krakov, sia per il panico riguardo all'indagine sia per chiudere i conti in sospeso.